A LISA rendszer alapja egy többrétegű adatbázis-kezelő rendszer. A háttéradatbázis adatai az adatbázisszerveren keresztül érhetők el a helyi hálózat közvetítésével. Az adatbázisban minden művelet azonosított adatbázis-felhasználón keresztül történik, beleértve az olvasási és adatmódosító műveletek is, illetve minden adatmódosítás naplózásra kerül.

A rendszer központi részét képezi még a számításokhoz szükséges Excel "számolómotorok" gyűjteménye, illetve egy speciális "irattár" a szerkesztés alatt álló, és az elkészült vizsgálati jegyzőkönyvek részére.

A kezelői programmodulok – a kliens gépekre telepíthető, vagy fájlkiszolgálóról futtatható – Windows alkalmazások. Az egyes modulok különálló fájlokban találhatók, így az egyes modulok az aktuális igényeknek megfelelően telepíthetők.

A kezelői programokban a szükséges számításokat Excel lapok végzik – a felhasználók által definiált módon. Az automatikusan generált vizsgálati jegyzőkönyvek RTF formátumban készülnek, amelyek Microsoft Word szövegszerkesztővel szerkeszthetők.

Az LISA ügyfél-tájékoztató modulja egy HTML alapú lekérdező rendszer, amely Interneten, vagy telefonos kapcsolaton keresztül érhető el a laboratórium ügyfelei számára.